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Nature:進(jìn)化中的CRISPR技術(shù)又有新突破

哈佛醫(yī)學(xué)院和麻省總醫(yī)院的研究者們在最新一期Nature雜志上發(fā)表了他們新改進(jìn)的CRISPR-Cas9技術(shù),識別序列的范圍更大,識別也更為精準(zhǔn)。文章第一作者Benjamin Kleinstiver介紹說新技術(shù)里的Cas9變種可以識別那些野生型Cas9無法修飾的人類和斑馬魚基因的位點(diǎn),這使得CRISPR技術(shù)在多變的基因組里識別范圍大大增加。

CRISPR-Cas9核酸酶由Cas9蛋白和20個核苷酸長的RNA分子組成。Cas9蛋白負(fù)責(zé)切斷DNA雙鏈,RNA分子用于識別目標(biāo)序列,不過在目標(biāo)序列旁邊還要有可以被Cas9識別的protospacer adjacent motif (PAM)才能讓酶發(fā)揮作用。實(shí)驗(yàn)室里通常使用的SpCas9來自于細(xì)菌Streptococcus pyogenes,它所需要的PAM序列一般為NGG形式,這在某種程度上限制了Cas9使用的范圍。

為了克服這一限制,該研究組建立了一套工程化系統(tǒng),用進(jìn)化研究的方法,從大量隨機(jī)突變的SpCas9變種中找到了可以識別新PAM序列的突變組合。這些新的Cas9變種將序列識別的范圍擴(kuò)大了兩倍。同時(shí)他們還發(fā)現(xiàn)了一個SpCas9變種可以減少基因編輯里的脫靶問題。此外,研究人員還在細(xì)菌Streptococcus thermophiles和Staphylococcus aureus里發(fā)現(xiàn)了兩個較小的Cas9直系同源蛋白St1Cas9和SaCas9。

文章的通訊作者Joung表示, 他們的新發(fā)現(xiàn)應(yīng)該對所有使用Cas9的研究人員有所幫助,另外他認(rèn)為此研究更重要的意義在于,他們首次證實(shí)SpCas9可以用定向蛋白質(zhì)進(jìn)化的方法改進(jìn),他們相信利用類似的方法還可以改進(jìn)Cas9酶其他的特點(diǎn)來滿足更多的需要。麻省總醫(yī)院已經(jīng)為文章中的SpCas9申請了專利。(生物谷Bioon.com)