在一項(xiàng)新的研究中,來(lái)自美國(guó)德州大學(xué)西南醫(yī)學(xué)中心的研究人員通過(guò)對(duì)腸道中的細(xì)菌群體進(jìn)行精準(zhǔn)編輯來(lái)阻止或減輕結(jié)腸炎小鼠模型中的炎癥嚴(yán)重程度。相關(guān)研究結(jié)果于2018年1月3日在線發(fā)表在Nature期刊上,論文標(biāo)題為“Precision editing of the gut microbiota ameliorates colitis”。
論文共同通信作者、德州大學(xué)西南醫(yī)學(xué)中心微生物學(xué)助理教授Sebastian Winter博士說(shuō),這種潛在的策略---靶向僅在腸道炎癥期間有活性的代謝通路---阻止或降低小鼠結(jié)腸炎模型中的炎癥,但是對(duì)具有健康的處于平衡狀態(tài)的細(xì)菌群體的對(duì)照小鼠沒(méi)有明顯的效果。他說(shuō),“我們的研究結(jié)果為精確地改變腸道中的細(xì)菌種類以便降低與在結(jié)腸炎和其他形式的炎癥性腸?。↖BD)中觀察到的細(xì)菌不受控制增殖相關(guān)聯(lián)的炎癥提供一種概念框架。”
Winter博士補(bǔ)充道,“我們強(qiáng)調(diào),這是一項(xiàng)概念驗(yàn)證研究:我們使用了一種鎢的形式,其中鎢是一種重金屬,當(dāng)高劑量使用時(shí)是有危險(xiǎn)的。攝入重金屬是不安全的。鑒于我們具有一種藥物靶標(biāo)[這種細(xì)菌代謝通路],我們的目標(biāo)是發(fā)現(xiàn)一種發(fā)揮著類似效果的安全療法。”
正常情形下位于腸道內(nèi)壁上的各種微生物群體,被稱為腸道微生物群,它們對(duì)人類健康是至關(guān)重要的。它們協(xié)助消化、訓(xùn)練免疫系統(tǒng)和抵御感染。然而,他解釋道,當(dāng)這些微生物群體變得不平衡時(shí),這些在正常情形下是有益的細(xì)菌就變成了一種負(fù)擔(dān),這就好比是園藝植物變得具有侵入性并將競(jìng)爭(zhēng)性的植物物種排擠出。了解腸道微生物的生物學(xué)特征的主要障礙之一是它具有廣泛的多樣性。在人體中,數(shù)百種不同的細(xì)菌種類在腸道中發(fā)現(xiàn)到,并且它們的細(xì)菌種類組成在不同的個(gè)體之間存在著顯著的變化。
腸道微生物群組成的變化在IBD(包括克羅恩病和潰瘍性結(jié)腸炎)等多種人類疾病中觀察到。據(jù)美國(guó)疾病控制與預(yù)防中心(CDC)估計(jì),美國(guó)至少有100萬(wàn)成年人受到IBD的影響。當(dāng)前,這種疾病是無(wú)法治愈或預(yù)防的。Winter博士說(shuō),2型糖尿病、結(jié)腸癌、HIV相關(guān)腸道疾病和某些早產(chǎn)兒中觀察到的壞死性小腸結(jié)腸炎也會(huì)出現(xiàn)腸道微生物群變化。
腸道微生物群中的一些與炎性疾病相關(guān)的細(xì)菌屬于腸桿菌科(Enterobacteriaceae)。包括非致病性大腸桿菌在內(nèi)的腸桿菌科細(xì)菌成員在健康腸道中少量地存在,并且阻止沙門(mén)氏菌等病原菌感染。論文共同第一作者、Winter實(shí)驗(yàn)室博士后研究員Wenhan Zhu博士說(shuō),不過(guò)在IBD患者和小鼠結(jié)腸炎模型中,屬于腸桿菌科的細(xì)菌成員不受控制地生長(zhǎng)。
在近期發(fā)表在Cell Host & Microbe期刊上的研究(doi:10.1016/j.chom.2017.07.018; doi:10.1016/j.chom.2017.11.006)中,Winter實(shí)驗(yàn)室已報(bào)道,腸桿菌科的細(xì)菌成員產(chǎn)生細(xì)胞能量用于生長(zhǎng)和獲得營(yíng)養(yǎng)物的方式不同于其他的腸道細(xì)菌。它們似乎使用獨(dú)特的代謝通路來(lái)促進(jìn)它們過(guò)度生長(zhǎng),并在疾病期間排擠出競(jìng)爭(zhēng)性的有益腸道細(xì)菌。
Winter博士解釋道,“這些通路是獨(dú)特的,這是因?yàn)樗鼈儍H存在于某些細(xì)菌中,而且僅在腸道炎癥中發(fā)揮功能。這就為合理設(shè)計(jì)針對(duì)IBD等與腸道炎癥相關(guān)的疾病的預(yù)防和治療策略提供了機(jī)會(huì)。”這種觀察導(dǎo)致了當(dāng)前的這項(xiàng)發(fā)表在Nature期刊上的研究:該研究使用重金屬鎢的一種形式來(lái)抑制病原菌的代謝通路。
Zhu博士說(shuō),“總體思路是鎢破壞腸桿菌科細(xì)菌成員產(chǎn)生能量的方式,減緩這些病原菌在炎癥期間的生長(zhǎng)。”這些研究人員發(fā)現(xiàn)鎢被細(xì)菌攝取,并且無(wú)意中被整入到一種重要的細(xì)菌輔助因子中。由此產(chǎn)生的這種中毒的輔因子不能夠正常地發(fā)揮功能,并破壞腸桿菌科細(xì)菌成員在發(fā)炎的腸道中產(chǎn)生能量的能力。他們說(shuō),在小鼠模型中,口服飲用水中的鎢酸鹽(一種可溶性的鎢鹽)會(huì)選擇性地阻止腸道中的腸桿菌科細(xì)菌成員大量繁殖。附近的有益菌不受影響,這明顯是因?yàn)樗鼈兊哪芰可纱x并不依賴于這種特定的輔因子。
Winter博士說(shuō),“值得注意的是,我們的策略僅抑制腸道炎癥期間腸桿菌科細(xì)菌成員的大量繁殖,而不會(huì)完全清除它們。這一發(fā)現(xiàn)是非常重要的,這是因?yàn)樵诤线m的比例下,腸桿菌科細(xì)菌成員也具有抵抗病原菌定植的作用。因此,在炎癥發(fā)作期間控制這些細(xì)菌的繁殖要優(yōu)于將它們從消化道系統(tǒng)中完全清除。”
Winter博士說(shuō),雖然實(shí)驗(yàn)證據(jù)比較少,但是人們長(zhǎng)期以來(lái)一直猜測(cè)腸道微生物組成的變化能夠讓疾病惡化。
在這項(xiàng)新的研究中,這些研究人員報(bào)道,就腸道細(xì)菌種類平衡而言,讓小鼠結(jié)腸炎模型接受鎢酸鹽治療會(huì)讓它們的腸道微生物菌群轉(zhuǎn)向更加正常的狀態(tài),并且也會(huì)降低腸道炎癥。鎢酸鹽治療并不能治愈這種疾病,但它改善了這些小鼠的整體健康狀況。
Winter博士說(shuō),“我們僅在‘概念驗(yàn)證’實(shí)驗(yàn)中使用鎢來(lái)鑒定一個(gè)潛在的分子靶標(biāo),而且我們離將這種基礎(chǔ)發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)化為患者中的一種治療方法的目標(biāo)仍然很遠(yuǎn)”。他補(bǔ)充道,接觸鎢能夠潛在地產(chǎn)生嚴(yán)重的負(fù)面影響,如神經(jīng)和生殖方面的危害。
傳統(tǒng)的治療方法集中于治療人類宿主。但是Winter博士解釋道,這些最新的結(jié)果有望給出一種新的策略:在原則上,利用正常的腸道細(xì)菌讓宿主取得積極的治療結(jié)果是有可能的,比如通過(guò)在腸道炎癥期間仔細(xì)地操縱腸道微生物群的功能和組成。
Winter 博士說(shuō),“當(dāng)醫(yī)生使用廣譜抗生素時(shí),其目標(biāo)是殺死盡可能多的細(xì)菌。如果病人在診所出現(xiàn)嚴(yán)重疾病,沒(méi)有時(shí)間來(lái)鑒定特定病原菌,廣譜抗生素將會(huì)被使用。廣譜抗生素對(duì)腸道微生物群的影響是毀滅性的。”
他說(shuō),“在我們的研究中,我們找到了一種僅靶向腸桿菌科的方法,而且是僅在炎癥期間。 還需開(kāi)展更多的研究來(lái)發(fā)現(xiàn)潛在的治療人類疾病的方法,但是這是很有希望的第一步。”
參考資料:
Wenhan Zhu, Maria G. Winter, Mariana X. Byndloss et al. Precision editing of the gut microbiota ameliorates colitis. Nature, Published online: 03 January 2018, doi:10.1038/nature25172
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